Kajian Skizofrenia Baru Berfokus pada Interaksi Protein-Protein

Sama seperti orang, banyak yang dapat dipelajari mengenai gen dengan melihat syarikat yang disimpannya dan memerhatikan bagaimana kelakuannya. Dalam usaha untuk mengungkap lebih banyak petunjuk mengenai perkembangan skizofrenia, para penyelidik di University of Pittsburgh School of Medicine meneroka bagaimana protein yang dihasilkan oleh gen yang berkaitan dengan skizofrenia berinteraksi antara satu sama lain.

"Kami dapat menyimpulkan apa yang mungkin dilakukan oleh protein dengan memeriksa syarikat yang disimpannya," kata penyiasat kanan Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., penolong profesor informatika bioperubatan, Sekolah Perubatan Pitt.

"Sebagai contoh, jika saya tahu anda mempunyai banyak rakan yang bermain hoki, ini juga bermaksud anda juga terlibat dalam sukan hoki. Begitu juga, jika kita melihat bahawa protein yang tidak diketahui berinteraksi dengan banyak protein yang terlibat dalam isyarat saraf, misalnya, ada kemungkinan besar bahawa entiti yang tidak diketahui juga terlibat dalam hal yang sama. "

Dalam sejarah baru-baru ini, saintis telah melakukan banyak kajian persatuan di seluruh genom (GWAS) yang berjaya mengenal pasti varian gen yang dikaitkan dengan peningkatan risiko skizofrenia. Walau bagaimanapun, sedikit yang diketahui mengenai protein yang dihasilkan oleh gen ini, apa yang mereka lakukan dan bagaimana mereka berinteraksi, kata para penyelidik.

"Kajian GWAS dan usaha penyelidikan lain telah menunjukkan kepada kita gen apa yang mungkin relevan dalam skizofrenia," kata Ganapathiraju. "Apa yang telah kami lakukan adalah langkah seterusnya. Kami cuba memahami bagaimana gen ini saling berkaitan, yang dapat menunjukkan kepada kita laluan biologi yang penting dalam penyakit ini. "

Ringkasnya, setiap gen membuat protein, dan protein ini biasanya berinteraksi satu sama lain dalam proses biologi. Mengkaji bagaimana protein ini berkelakuan satu sama lain dapat menjelaskan peranan gen yang belum dipelajari, mendedahkan laluan dan proses biologi yang berkaitan dengan skizofrenia serta kaitannya dengan penyakit kompleks lain.

Setelah mengembangkan dan menggunakan model komputasi baru, yang disebut Prediksi Interaksi Protein Berketepatan Tinggi (HiPPIP), para penyelidik menemui lebih daripada 500 interaksi protein-protein baru (PPI) yang berkaitan dengan gen yang berkaitan dengan skizofrenia.

Para penyelidik menambah bahawa walaupun gen yang berkaitan dengan skizofrenia dikenal pasti secara sejarah dan melalui GWAS mempunyai sedikit pertindihan, model menunjukkan mereka berkongsi lebih daripada 100 interaksi biasa. Penemuan ini dapat membawa kepada pemahaman yang lebih mendalam mengenai asas-asas biologi penyakit mental ini, dan juga menunjukkan cara rawatan.

Penemuan ini diterbitkan dalam talian di npj Skizofrenia, jurnal Nature Publishing Group.

Sumber: Pusat Pengajian Sains Kesihatan Universiti Pittsburgh